Ueki est un jeune garçon capable de changer les déchets en plante ou en arbre. Ce pouvoir lui a été confié par un Dieu dans un but bien précis: Ueki va devoir participer à une série d'épreuves dont la récompense est de devenir à son tour un nouveau Dieu. Malheureusement, utiliser un tel pouvoir , le "Zai" plus précisément, a une grave conséquence sur le charme de Ueki qui diminue à chaque utilisation de celui-ci. Arrivera-t-il à surmonter toutes ses épreuves avant que son "Zai" ne disparaisse?